Agersennep tilhører korsblomstfamilien og plantens frø er traditionelt brugt i Danmark som ingrediens i sennep. Pga. indholdet af en særlig type glucosinolater, som kan nedbrydes til stoffer, der kan påvirke skjoldbruskkirtlens hormoner hos dyr, bør frø og blade ikke spises i store mængder.
Frøene kan dog anvendes som krydderi og bladene som krydderurt. Eksempelvis kan en del af sennepsfrøene erstattes af agersennepsfrø ved fremstilling af sennep.
Agersennep kan forveksles med en række andre gulblomstrede arter fra korsblomstfamilien, eksempelvis agerkål, raps, gul sennep og udspærret vinterkarse, som dog ikke giver sundhedsmæssige bekymringer, selvom de fejlagtigt skulle blive anvendt i den tro, at de var agersennep.